影響牧草種子發芽率的內部因素。影響牧草種子發芽率的原因有很多，而所謂的內部因素就是指種子本身的問題而影響到其發芽率的因素。在存放或者收獲不恰當，就會對種子的質量以及發芽率造成較大的影響。

越成熟的種子發芽率越高，成熟度高的種子果實體內有著更高的營養物質，滿足其發芽過程中所需要的養分。而未能完全成熟就會造成籽粒不飽滿，營養含量匱乏甚至胚胎發育不完全，從而對其發芽率有著很大的影響。這也就對于種子的收獲時間有著嚴格的規定，按照牧草不同品種了解其收獲時間，準確的進行收獲，保證產品的成熟度。

另外，在加工儲存的過程對于產品的發芽率也有著很大的影響。其中種子的含水量是決定其萌芽生長的重要元素之一。在一定的范圍之內，水分含量越多，其萌芽率也就越高，但是如果種子含水量過高就會造成其儲存不易，腐爛，霉變，對其質量以及發芽率都有著很大的影響。而含水量過少，就會造成表皮過于堅硬，影響發芽生長，而且如果種子脫水速度過快，就會造成胚胎死亡，不能發芽。

除此之外，影響牧草種子發芽的原因還包括藥劑包衣，正確進行藥劑包衣可以防止在種植后不受病菌以及昆蟲的侵蝕，更好的保證籽粒的完整性，提高發芽率；但是如果所使用的藥劑不合格或者劑量過大就會過猶不及，對產品造成一定的侵蝕和污染，使其萌發緩慢，且發芽率較低。

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