一、應遵循的幾個原則
一是選擇的品種要適合本地的審美習慣。因不同的地方對花卉的審美有不同的觀點，包括花色、花朵大小以及一些特殊的風俗習慣要求等。二是選擇的品種要和季節相對應。有些品種季節性很強，如羽衣甘藍、雛菊、金盞菊、三色堇等，適合秋季播種；夏堇、雞冠花、長春花、千日紅等適合春夏季播種；而一串紅、四季海棠、萬壽菊、百日草、矮牽牛等只要條件適宜，四季均可播種。三是要根據自身的生產條件和技術水平來選種。如雜交1代（即f1代）草本花卉育苗條件要求較高，一般需要在保護地育苗。特別是進行反季節栽培時，更要注意溫度、濕度和光照條件的控制。四季海棠、矮牽牛等，其種子微小，沒有熟練的播種技術和合適的育苗條件，很難達到理想的效果。
二、確定選擇時期
在花卉栽培中，應結合不同類型的花卉及栽培上的實際需要，可在以下幾個時期進行選擇，以棄劣選優。一是幼苗期的選擇。在移植或定植時，根據植物性狀的相關性進行一次選擇，保留具有優良典型性狀的植株，淘汰那些優良性狀不明顯或有分離變異的植株。二是初花期的選擇。草花品種的良種繁育應抓住這一時期除雜去劣，能有效地保持其早花的優良性狀。三是盛花期的選擇。盛花期是確定花朵典型性狀的最佳選擇期，一般采用混合選擇的方法，即按照所栽培花卉的觀賞性及經濟性狀，從一個原始的混雜群體或品種當中，選出具有優質花色或優良性狀的植株，種植后次年再與標準品種進行鑒別比較，這樣經過一次或多次選擇，便能選出后代不再分離的、具有優良性狀的植株。
而有些草本花卉，如雞冠花、金魚草、瓜葉菊、三色堇、石竹類等，因品種間極易出現天然雜交的現象，引起品種間的混雜、退化。對這類花卉選種時，要特別注意采取品種間的隔離措施，防止串粉，使后代發生變異。對于某些菊花類草花，如波斯菊、瓜葉菊等，其花由舌狀花和管狀花兩部分組成，選擇這類花卉的留種單株時應特別注意不引人注目的管狀花的顏色，如果單純依據引人注目的舌狀花的顏色留種單株，則往往會造成優良花色逐步退化的情況。
三、選擇的部位
從選種的角度看，同一單株不同部位的花序或小花所產生的種子，其保留品種典型性程度也不同。一般規律是在種株上最先開的花，能比晚開的花產生更好的種子后代，如花期早、花朵大、花色艷等。以雞冠花為例：以中央花序的中下部產生的種子為佳。金魚草總狀花序中下部的種子結實率高。還有百日草、千日紅、半枝蓮、紫茉莉等也是如此。
對于某些花朵著生于主枝和側枝上的花卉品種，如波斯菊、矮牽牛、金魚草等，每個果實中的種子重量一般由下而上遞減，發芽率也由下而上遞減，它們所產生的后代在長勢上也有顯著的差異，因此，這樣就要選擇下部花朵所產生的種子。即使同一花序不同位置的種子，其后代保留品種典型性的程度也不同。如翠菊、萬壽菊、矢車菊等菊類花卉，著生在花盤邊緣的種子，最能保持其優良性狀。花盤中心所結的種子籽粒不壯，優良性狀不理想，最好不宜留種使用。
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